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DeepMind推出AlphaFold,可通過氨基酸序列預測蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)

發(fā)布時間:2018-12-04 14:53:39來源:pingwest

  PingWest 品玩 12 月 4 日訊,根據(jù)英國衛(wèi)報報道,周日在墨西哥坎昆舉辦的一場國際會議中,DeepMind 的最新 AI——AlphaFold 成功地根據(jù)基因序列預測出蛋白質(zhì)的 3D 形狀。

  “蛋白質(zhì)折疊”是一種分子折疊形式。生物由蛋白質(zhì)構(gòu)成,生物體功能由蛋白質(zhì)形狀決定。理解蛋白質(zhì)的折疊方式可以幫助研究人員更好的了解蛋白質(zhì)本身的功能。

  DeepMind 為預測“蛋白質(zhì)折疊”開發(fā)了 AlphaFold,并以該項目參加了 Critical Assessment of Structure Prediction (CASP)。CASP 是一年兩次的蛋白質(zhì)折疊奧運會,吸引了來自世界各地的研究小組。比賽的目的是根據(jù)氨基酸列表來預測蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu),這些氨基酸列表會在幾個月內(nèi)每隔幾天發(fā)送給參賽團隊。這些蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)最近已經(jīng)通過傳統(tǒng)方法破解,作為比賽的正確答案。

  盡管是首次參加比賽,AlphaFold 就在 98 名參賽者中名列榜首,準確地從 43 種蛋白質(zhì)中預測出了 25 種蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)。而同組比賽中獲得第二名的參賽者僅準確預測出了 3 種。值得一提的是,AlphaFold 關(guān)注從零開始建模目標形狀,并不使用先前已經(jīng)解析的蛋白質(zhì)作為模板。AlphaFold 在預測蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的物理性質(zhì)上達到了高度的準確性,然后基于這些預測可以使用兩種不同的方法預測構(gòu)建完整的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)。
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